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            pBM18A Toposmart Cloning Kit 克隆試劑盒
            產(chǎn)品編號:JCL073-02
            別名  
            英文名  
            pBM18A Toposmart Cloning Kit  克隆試劑盒
            上海研謹生物專業(yè)銷售(pBM18A Toposmart Cloning Kit  克隆試劑盒)歡迎您咨詢訂購!
            產(chǎn)品信息:
             
            組分 JCL073-01 (20) JCL073-02 (20×3)
            pBM18A Vector (20ng/ml ) 20ml 20ml×3
            10×Toposmart 20ml 20ml×3
            Control Insert LacZα 5ml 5ml
            M13F(-47) Primer 0.1OD 0.1OD×3
            M13R(-48) Primer 0.1OD 0.1OD×3
            產(chǎn)品介紹:
            pBM18ATopotsmart克隆試劑盒利用痘苗病毒的拓撲異構(gòu)酶I(Topoisomerase I)的切割再連接的特點將片段克隆到載體中,不僅適用于克隆由Pfu、KOD、Xerox、Phusion和Q5等高保真DNA聚合酶擴增的平末端PCR產(chǎn)物,也可克隆由Taq、Tth和klenTaq等DNA聚合酶擴增的帶A尾的PCR產(chǎn)物。陽性克隆可用M13F(-47)和M13R(-48) 引物進行菌落PCR鑒定。SmaI和XhoI單酶切可將克隆片段酶切出來。載體的多克隆位點兩側(cè)具有SP6和T7 RNA聚合酶啟動子序列, 可用于體外RNA轉(zhuǎn)錄。載體不含LacZ基因,不能進行藍白斑篩選。

            產(chǎn)品特點:

            1. 使用各種DNA聚合酶擴增的PCR產(chǎn)物。
            2. PCR 引物 5’端不能進行磷酸修飾,普通商業(yè)化引物即可。
            3. 載體采用了新的制備工藝,無需藍白斑篩選。
            4. 載體具有氨芐青霉素抗性。操作步驟

            1. 連接反應

            按下表,在一個 0.2ml PCR 管中依次加入
             
            成分 體積
            DNA 片段 0.5-8ml
            pBM18A Vector 1ml
            10×Toposmart 1ml
            補水至總體積 10ml
             
            加完試劑后,輕輕混勻低速離心,使溶液集中在管底。注意:此步驟不要在低溫條件下(冰水浴)上操作。

            2. 反應溫度及片段要求

            室溫下(20-30℃)放置 5-30 分鐘,然后將離心管放置在冰上。如當天不進行轉(zhuǎn)化實驗。請將連接產(chǎn)物置于-20℃保存。
            注意:DNA 片段的用量見下表
             
            片段大小(bp) 最佳用量(ng)
            100-1000 20-50
            1000-2000 50-100
            2000-5000 100-200
            室溫下(20-30℃)反應時間 5-30 分鐘,如果室溫較低,推薦使用 PCR 儀控溫。可以設置 25℃反應 5-30 分鐘。如果 PCR 產(chǎn)物電泳檢測僅有很銳利明亮的條帶, 無引物二聚體和非特異性條帶存在,可直接取 0.5-1ml 的 PCR 產(chǎn)物原液進行克隆。

            3. 陽性對照反應

            取 1ml 試劑盒提供的 1kb 長度的對照片段 LacZ 基因 α肽片段進行克隆,轉(zhuǎn)化具有α互補功能的大腸桿菌感受態(tài)細胞(如 DH5α,TOP10,Mach1T1 等)。菌液涂布在含有 IPTG 和 X-gal 的 LB 氨芐平板上,次日藍色菌落為陽性克隆,說明有片段插入,白色菌落為空載體。

            4. 轉(zhuǎn)化

            (1)取 5ml 連接產(chǎn)物到 50-100ml 剛剛?cè)诨母惺軕B(tài)細胞中,輕輕混勻,冰浴
            20-30 分鐘。
            (2)42℃水浴中熱擊 30 秒。
            (3) 立刻置于冰水浴中 2 分鐘。
            (4) 加入 300-500μl 無菌的不含抗生素的SOC 或 LB,37℃,200-250rpm 振蕩培養(yǎng) 60 分鐘。
            注:小于 2kb 片段可以不復蘇,直接涂平板。
            (5) 吸取 200ml 菌液涂布。為了得到更多的菌落,可以先 4000rpm 離心 1 分鐘,去掉部分上清,用移液器輕吹菌體,充分懸浮菌液,取全部菌液涂布,然后37℃培養(yǎng)過夜(12-16 小時)。
            5. 陽性重組子的鑒定菌落 PCR
            (1) 菌落PCR方法鑒定陽性克隆
             
            ① 用10ml吸頭挑選克隆至預先加有10ml無菌水或LB培養(yǎng)基的PCR管中, 吹打混合。
            ② 25ml PCR反應體系:取2ml細菌懸液為模板、加入5mM 濃度的M13F(-47)、
            M13R(-48)各1ml進行PCR擴增。
            ③PCR擴增條件:95℃預變性5分鐘(裂解細胞,失活核酸酶),94℃變性10秒鐘,55℃退火10秒鐘,72℃延伸( 根據(jù)片段的大小決定延伸時間,通常每1min/1kb)X秒,30個循環(huán),72℃后延伸5分鐘。1%瓊脂糖凝膠電泳分析擴增結(jié)果,有強烈的明顯條帶的克隆為重組體,與插入片段大小相近【M13F(-47)、M13R(-48)引物在克隆位置的兩側(cè),所以PCR 擴增出的DNA的長度比插入片段大229bp】可視為陽性克隆。菌落PCR 方法鑒定重組子時一定要設立一個不加菌液的陰性對照。
            (2) 測序:用M13F(-47)、M13R(-48)通用引物對陽性質(zhì)粒進行測序分析。

            6. 

             
             
            pBM18A載體圖譜7. 常見問題分析
            (1) 重組子克隆菌少,或陽性率低:感受態(tài)效率低,使用轉(zhuǎn)化效率>5×107cfu/μg 的感受態(tài)細胞
            (2) 連接反應在低溫下(如放碎冰上)操作,應該在室溫下操作。
            (3) PCR 片段加入量太多或太少,按照推薦量加入。
            (4) PCR 純度低,重新擴增或重新純化 PCR 產(chǎn)物。
            (5) PCR 質(zhì)量低,切膠時在紫外下照射時間長,需重新制備。
            (6) PCR 擴增結(jié)束后,應該再延伸 5-10 分鐘,確保片段延伸完全。
            (7) 轉(zhuǎn)化后沒有復蘇培養(yǎng),可以加入SOC 或 LB,培養(yǎng) 60 分鐘。克隆基因可

            能對宿主菌有毒性,比如某些編碼膜蛋白和DNA 結(jié)合蛋白的基因,某些啟動子和調(diào)節(jié)序列基因,或含有倒置或串聯(lián)重復序列的基因,選用室溫過夜培養(yǎng)平板,或換用低拷貝質(zhì)粒載體。

            載體序列:

            >pBM18A 1952bp AAAGGCCCACCCGTGAAGGTGAGCCAGTGAGTTGATTGCGCCAGGGTTTTCCCAGTCACGACGTTGTA AAACGACGGCCAGCCAATTGAAGCTATTTAGGTGACACTATAGATATCGAGCTCGAGGATCCATGGTA
            CCCGGGCGTGTCG CGACACGCCCGGGTCTAGACTGCAGCTCGAGGCATGCAAGCT
            TTGCCCTATAGTGAGTCGTATTACAATTCCATCCATAGCTGTTTCCTGTGTGAAATTGTTATCCGCGT CCATAGCAGAAAGTCAAAAGCCTCCGACCGGAGGCTTTTGACTTGATCGGCACGTAAGAGGTTCCAAC TTTCACCATAATGAAATAAGATCACTACCGGGCGTATTTTTTGAGTTATCGAGATTTTCAGGAGCTAA GGAAGCTAAAATGAGTATTCAACATTTCCGTGTCGCCCTTATTCCCTTTTTTGCGGCATTTTGCCTTC CTGTTTTTGCTCACCCAGAAACGCTGGTGAAAGTAAAAGATGCTGAAGATCAGTTGGGTGCACGAGTG GGTTACATCGAACTGGATCTCAACAGCGGTAAGATCCTTGAGAGTTTTCGCCCCGAAGAACGTTTTCC AATGATGAGCACTTTTAAAGTTCTGCTATGTGGCGCGGTATTATCCCGTATTGACGCCGGGCAAGAGC AACTCGGTCGCCGCATACACTATTCTCAGAATGACTTGGTTGAGTACTCACCAGTCACAGAAAAGCAT CTTACGGATGGCATGACAGTAAGAGAATTATGCAGTGCTGCCATAACCATGAGTGATAACACTGCGGC CAACTTACTTCTGACAACGATCGGAGGACCGAAGGAGCTAACCGCTTTTTTGCACAACATGGGGGATC ATGTAACTCGCCTTGATCGTTGGGAACCGGAGCTGAATGAAGCCATACCAAACGACGAGCGTGACACC ACGATGCCTGTAGCAATGGCAACAACGTTGCGCAAACTATTAACTGGCGAACTACTTACTCTAGCTTC CCGGCAACAATTAATAGACTGGATGGAGGCGGATAAAGTTGCAGGACCACTTCTGCGCTCGGCCCTTC CGGCTGGCTGGTTTATTGCTGATAAATCTGGAGCCGGTGAGCGTGGGTCTCGCGGTATCATTGCAGCA CTGGGGCCAGATGGTAAGCCCTCCCGTATCGTAGTTATCTACACGACGGGGAGTCAGGCAACTATGGA TGAACGAAATAGACAGATCGCTGAGATAGGTGCCTCACTGATTAAGCATTGGTAATGAGGGCCCAAAT GTAATCACCTGGCTCACCTTCGGGTGGGCCTTTCTGCGTTGCTGGCGTTTTTCCATAGGCTCCGCCCC CCTGACGAGCATCACAAAAATCGATGCTCAAGTCAGAGGTGGCGAAACCCGACAGGACTATAAAGATA CCAGGCGTTTCCCCCTGGAAGCTCCCTCGTGCGCTCTCCTGTTCCGACCCTGCCGCTTACCGGATACC TGTCCGCCTTTCTCCCTTCGGGAAGCGTGGCGCTTTCTCATAGCTCACGCTGTAGGTATCTCAGTTCG GTGTAGGTCGTTCGCTCCAAGCTGGGCTGTGTGCACGAACCCCCCGTTCAGCCCGACCGCTGCGCCTT ATCCGGTAACTATCGTCTTGAGTCCAACCCGGTAAGACACGACTTATCGCCACTGGCAGCAGCCACTG GTAACAGGATTAGCAGAGCGAGGTATGTAGGCGGTGCTACAGAGTTCTTGAAGTGGTGGCCTAACTAC GGCTACACTAGAAGAACAGTATTTGGTATCTGCGCTCTGCTGAAGCCAGTTACCTCGGAAAAAGAGTT GGTAGCTCTTGATCCGGCAAACAAACCACCGCTGGTAGCGGTGGTTTTTTTGTTTGCAAGCAGCAGAT TACGCGCAGAAAAAAAGGATCTCAAGAAGATCCTTTGATTTTCTACCGAAG
            本產(chǎn)品僅供研究,不用于臨床診斷

            上海研謹生物是一家專業(yè)從事生化試劑、分子生物學試劑、實驗耗材及實驗儀器研發(fā)、銷售、服務為一體的專業(yè)性生物科技公司。目前公司銷售、代理:Invitrogen、Amersham、sigma、Aldrich、Amresco 、YOYOBIO、BD(Difco)、Thermo、Fluka、Merck、Omega、PALL、Millipore、Peprotech、Pierce、Roche、Eppendorf、 BioHiT、Whatman、Axygen、corning、Pharmaia、等諸多品牌。 0 
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